CLC Sequence Viewer

Skjermbilde programvare:
CLC Sequence Viewer
Prog.varedetaljer:
Versjon: 7.7.1 Oppdatert
Last opp dato: 1 Oct 16
Utvikler: CLC bio
Lisens: Gratis
Popularitet: 288
Størrelse: 71872 Kb

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

CLC Sequence Viewer skaper et programvaremiljø som gjør det mulig for brukere å gjøre et stort antall av bioinformatikk analyser, kombinert med glatt data management, og gode grafisk visning og utenheter.

Hva er nytt i denne slipp:

Nye funksjoner og forbedringer

  • All NCBI server kommunikasjon er nå kryptert. (NCBI skal flytte alle webtjenester til HTTPS protokollen på 30 september 2016). & Nbsp;

  • Listen av enzymer pre-installert i arbeidsbenken & nbsp; har blitt oppdatert fra REBASE.

  • Quick Launch verktøyet er nå funnet under Toolbox menyen i stedet for Vis-menyen og en knapp som heter Launch som bringer opp dette verktøyet er lagt til verktøylinjen.

  • alternativet "er ikke på listen" er innført som et nytt bord filtreringsalternativ.
  • "Sort mappe" verktøyet bruker nå numerisk sortering for filnavn starte med et tall.

  • Nye plassholdere er tilgjengelige når du definerer navnene på eksportøren utganger: & nbsp; {User} & nbsp; {host}, og for elementer av tidsstempelet for produksjonen objekt, {år}, & nbsp; {måned} & nbsp; {dag} & nbsp; {time, & nbsp; {minute}, & nbsp; . {andre} & nbsp;
  • Plassholdere innenfor eksport utgang navnene som var tidligere bare tilgjengelig som sifre kan nå spesifiseres ved hjelp av skriftlige navn: {innspill} er et synonym for {1} {forlengelse} er et synonym for {2} og {teller} er et synonym for {3}.
  • GenBank import nå også gir mulighet for filnavn med 'GBFF' forlengelse.

  • Les gruppeinfo vises nå på Element info visning av sekvenslister.

Bugfiks
  • Reparert et sjeldent problem hvor noen merknader kunne , men ikke nødvendigvis, gå mangler på & nbsp; sekvenser med mer enn 1000 kommentarer av en gitt type på at sekvensen før slettingen og hvor høyreklikkkontekstmenyen alternativet "Slett utvalg" ble brukt. & nbsp;

  • Fikset en bug i "Manage Enzymer" wizard som forhindret en bruker fra å avbryte handlingen hvis "Lagre som nytt enzym liste" ble aktivert.

  • Fast et problem med Import Metadata verktøyet der, hvis et regneark hadde allerede blitt lastet, og deretter velge det samme regnearket igjen ikke laste inn regnearket innhold.

  • Fast et problem der det tok lang tid å åpne en arbeidsbenk det det var & nbsp; previouslyclosed når du viser en åpen tabell redaktør som hadde blitt sortert. & nbsp;

  • Fikset et problem å høyreklikke på en graf i en rapport og velger å vise "report", "Historie" eller "Element info" utløste en feil.

  • Ulike mindre feilrettinger .

Hva er nytt i versjon 7.7:

  • Alle Excel ark i et dokument er nå importert og hvert ark har en tabell som er opprettet for innholdet.
  • CSV, HTML og Excel-tabell / tabell eksportør nå bruke "Inf "og" NaN "verdier for å erstatte den tvetydige"? ".
  • i veiviseren for eksport en tabell i CSV-format, når ikke eksportere alle kolonner, er det nå mulig å avbryte eller gå tilbake til forrige trinn mens valgte kolonnene legger. & nbsp;
  • Samme utskriftsinnstillingene kan nå søkes om flere rapporter i en enkelt eksport. & nbsp;
  • "Manage Resources" -kategorien er fjernet fra . den Plugin manager

Hva er nytt i versjon 7.6.1:

Feilrettinger

  • Fikset et problem der noen filtrering operasjoner, for eksempel "inneholder ikke" ikke handlet riktig ved filtrering av tabellceller som inneholdt flere typer informasjon.
  • Fast et problem der merknader som spredte endene av en sirkulær sekvens ville bli feilaktig plassert i rundskriv Sequence view.
  • Fikset en bug som forårsaket arbeidsbenken for å fryse dersom visse sekvenser ble vist i rundskrivet visning med radial gjengivelse av etiketter.
  • Fikset et problem der noen filtrering operasjoner, for eksempel "inneholder ikke" ikke handle riktig når filtrere tabellceller som inneholdt flere typer informasjon.
  • Fikset et problem som forhindret en rot mappe på Windows-stasjoner fra å bli brukt som en Filplassering.
  • Fikset et problem der oppdatering av en eksisterende installasjon på Windows vil resultere i .vmoptions filen blir slettet, noe som gjør Workbench kjøre med . standard Java-konfigurasjon

Hva er nytt i versjon 7.6:

Nye funksjoner og forbedringer

  • En 3D Molecule Viewer er nå tilgjengelig for visualisering av protein, RNA, DNA, og små molekyler.
  • Forbedret rapportering av feil relatert til lite diskplass.
Bugfiks
  • Fikset problem med lenker og tekst i tabeller som ble kuttet da lykkes en link
  • Restriksjoner nettstedet analyse. verdiene "Cut posisjon (s) "kolonnen i restriksjonssetet analyse tabellen nå oppfører seg som tall i stedet for tekst, noe som betyr sortering og filtrering fungerer.
  • Et problem med lagrede bordbrikker som noen ganger ikke fungerte har blitt fikset. Den bug fix inkluderer en mer robust / generisk måte å spare bordbrikker med forskjellige kolonner. For å løse dette problemet, bør eksisterende lagrede bordbrikker først lastes på et objekt hvor det fungerer (dvs. har de samme kolonnene som da den ble lagret); og deretter bordbrikker bør lagres med det gamle navnet for å erstatte innstillingene & nbsp;

  • Metadata for fylogenetiske trær. En feil har blitt fikset & nbsp; med import av metadata som inneholder kolonne navn med kolon.

  • Fast feil når du viser protein oversettelser av merknader er kortere enn 3 baser.

Hva er nytt i versjon 7.5.

  • De ubrukte "Arbeidsflyt" -knappen har blitt fjernet fra verktøylinjen
  • Local Search aktivert fra menylinjen inneholder nå filtrering på "bane".
  • Avansert filtrering på tabeller inneholder nå mulighet til å filtrere for et mellomrom, komma eller semikolon avgrensede termlister.
  • Zoom verktøy redesign. Zoom til valg funksjonen er nå også tilgjengelig for sekvenser, sekvenslister, justeringer, og lese kartlegginger
  • Lagring / søknad sidepanelinnstillinger for tabeller nå fungerer for ulike tabeller som dele noen kolonner. & nbsp;.
  • kopierings~~POS=TRUNC kan nå bli stoppet

  • Import av eksempel data og import gjort gjennom å dra filer til arbeidsbenken og slippe dem i navigasjonsområdet vil ikke lenger blokkere brukergrensesnittet mens utføring. I stedet skjer importen som en bakgrunnsprosess som kan overvåkes og styres via kategorien Prosesser i nedre venstre hjørne.

  • CLC arbeidsbenker støtter nå skjermer med høy oppløsning som Apple Retina skjermer av alle data som vises i visningsområdet (inkludert verktøytips).
  • Mer informativ navngiving av regionens oversettelser koding produsert av verktøyet Trans til protein. Navnet for en kodende region oversettelse består av navnet på inngangssekvensen etterfulgt av kommentaren type og endelig kommentaren navn.

Lignende programvare

Aabel
Aabel

22 Nov 14

Pairwise Tests
Pairwise Tests

3 Jan 15

Mac GrayLiner
Mac GrayLiner

4 Jan 15

Annen programvare fra utvikleren CLC bio

Kommentarer til CLC Sequence Viewer

Kommentarer ikke funnet
Legg til kommentar
Slå på bilder!