Swiss-PdbViewer

Skjermbilde programvare:
Swiss-PdbViewer
Prog.varedetaljer:
Versjon: 4.0.1
Last opp dato: 3 Jan 15
Lisens: Gratis
Popularitet: 691
Størrelse: 13683 Kb

Rating: 5.0/5 (Total Votes: 1)

Swiss-PdbViewer (aka DeepView) er et program som gir et brukervennlig grensesnitt som tillater å analysere flere proteiner samtidig. Proteinene kan legges over for å utlede strukturelle justeringer og sammenligne sine aktive områder eller andre relevante deler. Aminosyre mutasjoner, H-obligasjoner, vinkler og avstander mellom atomer er lett å få tak takket være den intuitive grafiske og menygrensesnittet.

Swiss-PdbViewer (aka DeepView) har blitt utviklet siden 1994 av Nicolas Guex. Swiss-PdbViewer er tett knyttet til SWISS-MODELL, en automatisert homologi modellering serveren utviklet innenfor den sveitsiske institutt for Bioinformatikk (SIB) ved Structural Bioinformatikk Group ved Biozentrum i Basel.

Arbeide med disse to programmer i stor grad reduserer mengden av arbeid som er nødvendig for å generere modeller, som det er mulig å tre et protein primære sekvensen til en 3D-mal og få en umiddelbar tilbakemelding om hvor godt den gjengede protein vil bli akseptert av referansen struktur før du sender en forespørsel om å bygge mangler sløyfer og avgrense sidekjede pakking.

Swiss-PdbViewer kan også lese elektrontetthetskart, og gir ulike verktøy for å bygge inn i tetthet. I tillegg ulike modelleringsverktøy er integrerte og kommandofiler for populære energi minimalisering pakker kan genereres.

Til slutt, som en spesiell bonus, POV-Ray-scener kan genereres fra den gjeldende visningen for å lage flotte ray-spores kvalitet bilder.

Hva er nytt i denne utgaven:

  • Tymin C6 atom nå riktig lastet
  • Fast POV-Ray-utgang endeløs sløyfe på PC-versjonen
  • Den sporadiske krasjer samtidig spare PDB-filer (for eksempel 2i37) på PC-en har blitt fikset
  • Oppdatert adressen til Uppsala Electron Density Map Server

Lignende programvare

I-Doser Free
I-Doser Free

12 Dec 14

iNMR reader
iNMR reader

22 Nov 14

XDrawChem
XDrawChem

18 Jun 18

Kommentarer til Swiss-PdbViewer

Kommentarer ikke funnet
Legg til kommentar
Slå på bilder!