QMForge prosjektet kan brukes til å analysere resultatene av kvantekjemi (DFT) beregninger. Gaussian 98/03, ADF, GAMESS (US), GAMESS (UK), PC-GAMESS, Jaguar, og ORCA filer støttes (se nedenfor). De følgende analyser er tilgjengelige:
· Mulliken Population Analysis (MPA)
· C-squared Population Analysis (SCPA)
· Overlapping Population Analysis (OPA)
· Mayer Bond bestillinger
· Charge Nedbrytnings Analysis (CDA)
· Fragment Analyse
MPA, CSPA, og OPA krever en brukerdefinert sett av fragmenter, og skriver ut prosent bidrag disse fragmentene gjør mot hverandre molekylorbital i molekylet. Mayer obligasjons ordre beregner obligasjons ordrer mellom hvert par av atomer i molekylet. CDA og fragmentanalyse krever tre eller flere beregninger (ett for hele molekylet, og to fragment beregninger), og gi informasjon om binding interaksjoner mellom fragmenter.
QMForge er direkte etterkommer av PyMOlyze, som ble inspirert av konsollbaserte, (opprinnelig) Windows-only program AOMix som har funksjoner, inkludert (og i tillegg til) de som er nevnt ovenfor. Jeg skrev opprinnelig PyMOlyze fordi jeg ønsket en brukervennlig (ie. Grafisk) Linux program for å gjøre MPA for hver molekylorbital av Gaussian beregninger. Jeg utvidet det til å håndtere filer fra geometrioptimaliseringer fordi jeg fant meg selv ønske jeg kunne oversette og rotere optimalisert struktur og lagre det som en XYZ fil. Nå har det blitt omdøpt QMForge, og jeg bruker den til nesten alt unntatt gjør molekylorbital bilder og diagrammer.
Det er fortsatt noen analyser som QMForge ikke gjør det, så hvis det ikke løser dine behov, sjekk ut AOMix (eller skyte meg en e-post og vi vil snakke).
QMForge har blitt opprettet ved hjelp av Python skriptspråk, den Qt4 toolkit og dets python utvidelser PyQt4, numeriske og cclib compuational pakken parsing bibliotek. Det har blitt testet på Windows XP, Windows 2000 og Mac OS X; det skal fungere like godt på alle GNU / Linux-distribusjon, selv om jeg ikke har testet den ennå.
Hva er nytt i denne versjonen:
· Navneendring til QMForge
· ORCA støtte
· Bytt til numpy 1.0.2 og openbabel 2.1.1
· Bruker cclib bygget fra 0,8 gren + unreleased ORCA parser
Kommentarer ikke funnet