BioPerl

BioPerl ble utviklet for å behandle biologiske data i Perl.
Det er et verktøy for å utforske Perl muligheter i bioinformatikk verden

Hva er nytt i denne utgivelsen:.

• Major Windows-relaterte oppdateringer
• MAKER oppdatering for å tillate for strengere standard kodon table
• Bedre støtte for sirkulære sekvenser
• Løser for noen komplekse plassering typer
• Adresse contig bug i GenBank format
• Deobfuscator fikser

Hva er nytt i versjon 1.6.922:.

• Adresse CPAN testfeil
• Lagd BIOPROJECT støtte for Genbank filer.
• Bedre regex støtte for HMMER3 utgang.

Hva er nytt i versjon 1.6.901:

• Bruk av AcePerl er foreldet; Ace.pm er ikke aktivt vedlikeholdt, og moduler ved hjelp Ace vil også bli foreldet.
• Minor bug fix-utgivelse.
• Bio :: SeqIO :: gbXML testene krever XML :: SAX.
• Adresse Build.PL problemer når DBI ikke er til stede.
• Hopp gbxml.t og Interpro tester når modulene ikke installert.
• Fjern Foreldet kode for perl 5.14.0 compat.
• På grunn av skjemaendringer og manglende støtte for eldre versjoner, er støtte for NeXML 0.9 bare (veldig) delvis implementert.