Gratis Bioinformatikk For Linux
Seal er et Python-modul som gir sekvens innretting på Hadoop.Seal er en av MapReduce søknad om biologisk sekvenssammenstillingen. Det kjører på Hadoop (http://hadoop.apache.org) gjennom Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), en Python MapReduce og HDFS...
TRMiner er en Python verktøy som tar sikte på vitenskapelige data kuratorer. & Nbsp; Det gjør det mulig å raskt beskjære store samlinger av vitenskapelige publikasjoner til setninger som er relevante for en gitt gruve mål.Dette er oppnådd i to trinn....
Pysam er et Python-modul for å lese og manipulere Samfiles. & Nbsp; Det er en lett wrapper av samtools C-API.Hurtigstartveiledningen er her. Mer detaljert dokumentasjon er tilgjengelig her.Spørsmål og kommentarer er velkomne, og skal sendes til den pysam...
PySCeS er et prosjekt utviklet av Triple-J Group for Molecular Cell fysiologi. & Nbsp; for å prøve modell og forstå de komplekse prosesser og systemer som utgjør den levende cellen Egenskaper . En tekstbasert modell beskrivelsesspråk En...
goby er en Python API for å lese binære datafiler opprettet ved hjelp av Goby neste generasjons data management rammeverk.Normalt kommer denne katalogen som en del av den komplette Goby pakken, tilgjengelig fra:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Den...
SSuMMo er et bibliotek med funksjoner laget rundt iterativt med hmmer å tildele sekvenser til taxa. & Nbsp; Resultatene er svært kommenterte trær som viser arter / slekten fordeling innenfor dette samfunnet.Programmer som er inkludert kildekoden...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er et effektivt program som justerer relativt korte nukleotidsekvenser mot en lang referanse sekvens slik som det menneskelige genom.Programvaren implementerer to algoritmer, BWA-kort og BWA-SW. Den tidligere verk for...
TORV er en pakke med programmer for å fange, forutsi og analysere biofysiske egenskapene til proteiner.Se http://enzyme.ucd.ie/PEAT for dokumentasjon, instruksjoner, skjermbilder osv Krav . ...
OpenElectrophy er et rammeverk for å lette manipulering, lagring og analyse av elektrofysiologiske data. Det kan importere data fra mange forskjellige filformater og lagre dem i en enkelt SQL-type database.Analyseverktøy som inngår i OpenELectrophy er...
NEO (Neural Ensemble Objects), og er et prosjekt for å gi et felles sett av grunnklasser som skal brukes i nevrale dataanalyse, med sikte på å få OpenElectrophy, NeuroTools og kanskje andre prosjekter med liknende mål mer tett sammen.To store mål er...
