Ny Bioinformatikk For Linux

Seal er et Python-modul som gir sekvens innretting på Hadoop.Seal er en av MapReduce søknad om biologisk sekvenssammenstillingen. Det kjører på Hadoop (http://hadoop.apache.org) gjennom Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), en Python MapReduce og HDFS...

avalanchetoolbox er en verktøykasse for å identifisere og beskrive forgrening prosesser, for eksempel nevronale snøskred Krav . ...

Murka er et gratis, på tvers av plattformer og åpen kildekode kommandolinje programvare som hjelper brukerne å enkelt løse Fylogeni problem, ganske enkelt ved hjelp Median Networks. Det inkluderer heuristiske metoder, eksakte algoritmer, samt en Steiner...

. HTSeq er en Python rammeverk for å behandle og analysere data fra high-throughput sekvensering (HTS) analyser Krav : < li>...

Orange-Bioinformatikk er en Orange nbsp data mining programvarepakke add-on &;. Den strekker Orange ved å tilby felles funksjonalitet for grunnleggende oppgaver i bioinformatikk. Det gir også widgets for Orange Canvas, som lar brukere som ikke er...

edittag er et program samling for utforming sett med redigerings metriske sekvens koder, sjekker sekvens koder for konformasjon til redigerings metrisk, og integrere sekvens koder til plattformspesifikke sekvense adaptere og PCR primere. edittag skiller...

VULCAN prosjektet gir beregningsvæskedynamikk analyse.VULCAN (Tykt Motvinds algoritme for Complex strømningsanalyse) tilbyr computational fluid dynamics for Subsonic fart gjennom hypersoniske turbulent reagerer og ikke-reagerstrømmer på en rekke serielle...

seriesoftubes er en utvidet rørledning for Solexa ChIP-seq data.Pakke Dokumentasjon Krav : ...

reciprocal_smallest_distance er en parvis orthology algoritme som bruker global sekvens justering og maximum likelihood evolusjonær avstand mellom sekvenser til nøyaktig oppdager ortologer mellom genomer. Installere Fra en tarball Last ned og pakk den...

Bygg systemer som gjør blir ofte brukt til å lage komplisert arbeidsflyt, f.eks i bioinformatikk. & nbsp; snakemake mål å redusere kompleksiteten i å lage arbeidsflyter ved å gi en ren og moderne domenespesifikk spesifikasjon språk (DSL) i python stil,...