GenoSuite er et rammeverk utviklet for proteogenomic analyse. FDRScore basert strategi brukes for å integrere resultatene fra flere søkealgoritmer. Prokaryote Proteogenomic Tool (PPT) er utviklet som en del av GenoSuite rammeverk. PPT er for å finne frem til nye oversettelser i prokaryote genomer, og er avhengig av massespektrometri basert proteomikk data og relatert genomsekvens. Funksjoner inkluderer konfigurert for fire åpen kildekode-algoritmer for å utføre database søker etter peptid identifikasjon og en kombinasjon av de fire algoritmen kan velges, lister opp de genom søke spesifikke peptider (Novel peptider), kan spektrale kampene visualiseres for kvalitetsvurdering, lister ut de nye proteinene og endringer i eksisterende protein merknader, og en visuell genomisk sammenheng med de nye peptider kan også bli generert.
Kommentarer ikke funnet