KEGG2SBML

Systems Biology Markup Language (SBML) er et XML-basert språk for beskrivelse for å representere beregningsmodeller i systembiologi og bioinformatikk.
KEGG2SBML evner er foreløpig begrenset til å konvertere bare KEGG metabolismen filer og ikke andre typer KEGG filer.
KEGG2SBML kan konvertere KEGG Pathway Database Versjons 46,0 eller senere. (Tidligere versjoner av KEGG Pathway Database har ikke blitt testet og kan ikke konverteres av KEGG2SBML.)
Det kan generere SBML nivå 1 og 2 (Versjon 1), med eller uten merknader brukes av CellDesigner og SBML Nivå 2 Versjon 2 og Nivå 2 Versjon 3 uten merknader.

Hva er nytt i denne utgaven.

• Endringer i parsing KEGG Pathway
• Endringer i parsing KEGG LIGAND.
• Endringer i skriftlig SBML.
• KGML brukes ikke lenger fra denne utgivelsen.