Miso (Blanding av Isoformer) er en sannsynlighets rammeverk skrevet i Python som quantitates uttrykket nivå & nbsp; av alternativt skjøtes gener fra RNA-Seq data, og identifiserer differensielt regulerte isoformer eller eksoner tvers prøver.
Ved å modellere den generative prosess som leser produseres fra isoformer i RNA-Seq bruker miso modellen Bayesian slutning til å beregne sannsynligheten for at en lese stammer fra en bestemt isoform.
Miso bruker inferred tildeling av lyder til isoformer å kvantifisere Forekomsten av den underliggende sett av alternative mRNA isoformer. Konfidensintervall enn estimatene kan oppnås, som kvantifisere påliteligheten av estimatene.
Vennligst se http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ for Miso manuell og dokumentasjon
Krav .
- Python
Kommentarer ikke funnet