Sigint prosjektet er et kommandolinje programvare verktøy som kan brukes til å finne og rangere pattedyr proteiner / gener som spesifikt og betydelig samhandle med en liste over proteiner / gener i sammenheng med en bakgrunn pattedyr signalome og interactome nettverk.
Inngangene til programmet er: (a) et frø liste over menneske Entrez Gene genet symboler, (b) en bakgrunn nettverk i SIG format, og (c) et navn for output file (web-side filnavn med htm forlengelse ). Sigint utganger en sortert liste av gener / proteiner som samhandler med komponenter fra frøet listen. Disse komponentene er sortert etter et Z-score som måler spesifisiteten av disse mellomliggende komponenter for å samhandle med genene / proteiner fra frø listen.
Sigint kan kjøres på Linux, Mac og Windows-operativsystemer og det krever en bakgrunn nettverk tekstfil i SIG format.
Bruk:
Pakk ut arkivet
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
Kommentarer ikke funnet