Ghemical er en beregningskjemi programvarepakke utgitt under GNU GPL. Det betyr at hele kildekoden til pakken er tilgjengelig, og brukerne står fritt til å studere og endre pakken. Ghemical er skrevet i C ++.
Ghemical Prosjektet har et grafisk brukergrensesnitt (som er basert på GNOME), og den støtter både kvante-mekanikk (semi-empirisk og ab initio) modeller og molekylmekanikk modeller (det er en eksperimentell Tripos 5.2-lignende kraftfelt for økologisk molecu også et verktøy for reduserte proteinmodeller [1] er inkludert. geometri optimalisering, molekyldynamikk og et stort sett av visualiseringsverktøy for tiden er tilgjengelige.
Ghemical er avhengig av ekstern kode for å gi kvantemekanisk beregninger. Semi-empiriske metoder MNDO, Mindo / 3, AM1 og PM3 kommer fra MOPAC7 pakken (Public Domain), og inngår i kilden distribusjon.
Den MPQC pakke (GNU GPL) brukes til å gi ab initio metoder: metoder basert på Hartree-Fock teori øyeblikket støttes med basissett som strekker seg fra STO-3G til 6-31G **.
Den MPQC koden er ikke inkludert i kildefordelingen. For å kunne bruke den MPQC baserte ab initio metoder i Ghemical, må du først kompilere og installere MPQC program for systemet ditt, og deretter kompilere Ghemical bruker noen spesifikke innstillinger som lenker programmene sammen; se INSTALL filen for mer informasjon. Ghemical inneholder også OpenBabel pakke for import og eksport av mange forskjellige filformater (samt andre oppgaver).
Installasjon
Når du har lastet ned den siste versjonen, bør du trekke ut alle filer fra arkivet fil ved hjelp av "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz" eller ekvivalent "gunzip ghemical-1.00.tgz; tjære -xvvf ghemical-1.00.tar". Etter det kan du lese "Install" -fil du bare trekkes ut for å få ytterligere informasjon.
Hva er nytt i denne versjonen:
Kommentarer ikke funnet