Ser protein-protein og ligand-protein interaksjoner som grafer (nettverk), hvor biomolekyler er representert som noder og deres interaksjoner er representert som koblinger, er en lovende metode for å integrere eksperimentelle resultater fra ulike kilder for å oppnå systematisk forståelse av molekylære mekanismer kjøring cellefenotype. Fremveksten av store signalnettverk gir en mulighet for topologiske statistisk analyse, mens visualisering av slike nettverk representerer en utfordring. SAVI implementerer standard metoder for å beregne clustering, tilkoblingsmuligheter distribusjon og diagnostisering, samt visualisering, nettverks motiver. I tillegg genererer SAVI en komplett nettside fra nettverks datasett i tekstformat. SAVI inneholder et verktøy kalt PathwayGenerator. Dette verktøyet lager tilkoblings kart som web-sider fra store tabeller som beskriver cellesignale interaksjoner. SAVI kan også opprette nettverk fra lister over gen / protein navn
Versjon 2.5 kan inkludere uspesifisert oppdateringer, forbedringer og feilrettinger
Krav :..
Windows (alle)
Kommentarer ikke funnet