Bio-Linux

Bio-Linux er et åpen kildekode operativsystem basert på den verdens & rsquo; s mest populære gratis distribusjon av Linux, Ubuntu, bygget rundt den moderne Unity skrivebordsmiljø, og designet fra bunnen av for å bli brukt av bioinformaticians.Distributed som en singel, dual-bue Levende DVDThe distro kan lastes ned fra Softoware som en enkelt, dual-bue Live-DVD ISO bilder på ca 3 GB i størrelse, som støtter både 64-bit (x86_64) og 32-bit (i386) instruksjonssett arkitekturer. Det må bli deployert til enten en USB flash-stasjon eller DVD-plate for å starte det fra BIOS på en computer.Boot optionsBeing basert på Ubuntu, og har et identisk boot loader, designet for å tillate deg å prøve operativsystemet uten å installere noe , direkte starte installasjonsprogrammet, teste RAM for feil, boot fra den første disken, samt å sjekke integriteten til oppstartbar medium (bare hvis du bruker en DVD-medier) .Modern og produktiv skrivebordsmiljø drevet av UnityAs nevnt, fordelingen & rsquo ; s standard og bare skrivebordsmiljø er Unity, som bruker et panel / dock layout. Mens panelet, som er plassert på den øvre delen av skjermen, er perfekt for å kommunisere med programmer som kjører, vil dokking hjelpe deg raskt starte din favoritt applications.Some av de beste åpen kildekode bioinformatikk appsSome av de beste åpen kildekode bioinformatikk applikasjoner er inkludert i denne Ubuntu-basert operativsystem, blant hvilke vi kan nevne loven Arb, Cn3D, cytoscape, Archaeopteryx, Artemis, BTmapqtl, clustalx, Dendroscope, DDV Sequence Alignment Viewer, Entrez, Eqtl, Galaxy, GAP4, GAP5, FastQC, Geneious, GGobi, ISACreator, King, LRmapqtl, mesquite og Jemboss.Bottom lineSumming opp, er Bio-Linux en virkelig rask og produktiv operativsystem basert på den nyeste oppstrøms Ubuntu-versjon og bruke GNOME Classic skrivebordsmiljø, samt noen av de beste open source bioinformatikk programmer

Hva er nytt i denne utgaven:.

• Løser en fersk utgave med skrivebordet unnlate å starte på VirtualBox på grunn av inkompatible drivere.
• Oppdateringer ulike pakker, spesielt QIIME og Bowtie-Bio verktøy.
• Legger pandaseq paret slutten assembler.
• Legger de oppdaterte nybegynnere tutorial spesifikke for Bio-Linux 8.

Hva er nytt i versjon 8.0.2:

• Ny Ubuntu 14.04 basesystemet støtter den nyeste maskinvaren og gir up-to-date kontor-programvare, multimedia osv.
• Oppdaterte versjoner av nøkkel bioinformatikk programmer som QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, Bowtie-Bio verktøy og mange flere (brukere som ikke oppgradere vil ikke lenger få oppdateringer).
• Up-to-date versjoner av mange R pakker, inkludert ggplot2, DESeq og Edger pluss oppdatert Bioconductor og tusenvis flere pakker tilgjengelig for direkte installasjon via C2D4U.
• Utdeling av pre-forberedt maler for bruk på VMWare / VirtualBox.
• Utskifting av NX med x2go, en mer fleksibel versjon av rask og sikker fjern desktop system.
• inkludering av MATE skrivebordet som et lett alternativ til Unity.
• En mer robust innpakning av Galaxy, med støtte for lasting verktøy-skur verktøy, Apache proxy, automatisert PostgreSQL oppsett, autentisering til lokale kontoer og SFTP filopplasting.
• En gratis kattunge med hver nedlasting!
• ... ok, jeg kan ha løyet om kattungen, men vi har noen flotte nye bakgrunnsbilder innsendt av brukeren samfunnet - se nedenfor
.

Hva er nytt i versjon 7.0.3:

• Bio-Linux 7 er et fullt utstyrt, kraftig , konfigurerbar og lett å vedlikeholde bioinformatikk arbeidsstasjon. Bio-Linux gir mer enn 500 bioinformatikk programmer på en Ubuntu Linux 12.04 LTS basen. Det er en grafisk meny for bioinformatikk programmer, samt enkel tilgang til Bio-Linux bioinformatikk dokumentasjonssystem og eksempeldata nyttig for testprogrammer.
• Bio-Linux 7 legger mange forbedringer i forhold til tidligere versjoner, inkludert Galaxy analysemiljø. Det finnes også ulike pakker å håndtere ny generasjon sekvens datatyper.
• Du kan installere Bio-Linux på maskinen din, enten som eneste operativsystem, eller som del av en dual-boot oppsett som lar deg bruke din nåværende system og Bio-Linux på den samme maskinvaren.
• Bio-Linux kjører også live fra DVD eller en USB-pinne. Dette kjører i minnet på maskinen din, og ikke involverer installere noe. Dette er en stor, ingen problemfri måte å prøve ut Bio-Linux, demonstrere eller undervise med det, eller å jobbe med når du er på farten.
• Bio-Linux er bygget på åpen kildekode-systemer og programvare, og så er fri til å installere og bruke.