compsort

Kommando linje verktøy for å sammenligne komma avgrenset datafiler ved hjelp av relative forskjeller å finne de mest lignende struktur. Compsort sammendatafilene ved hjelp av relativ forskjell, beregner en likhet score, sorterer resultatet i stigende rekkefølge (lavere verdier representerer større likhet), sparer x antall lav score.
Datafilene som produseres av brukeren, må være komma avgrenset tekstfiler. Hver fil representerer en unik molekyl. Hver rad i en fil representerer en unik konformasjon av molekylet. Den første kolonnen i datafilen skal være en etikett som er unik for konformasjonen representert ved rekken. Resten av kolonnene er numeriske beskrivelser, for eksempel avstands plass målinger.
Radene blir sammenlignet combinatorially mellom filer. Etikettene i sammenligning deles og lagres med resultatet for sett med rader. Dette gir en måte å identifisere de conformations som produserte en gitt likheten poengsum.

Fremtidig arbeid inkluderer:

• legge GUI grensesnitt
• legger papir på min 3D pharmacophore modellering algoritme
• En parallell versjon ved hjelp av MPI

Hva er nytt i denne utgaven:

• fikset et par mindre kompilatoren advarsler
  
• lagt rapportering av beregningstiden for sett med kombinatoriske beregninger i tillegg til den tidligere rapportert slags tid
  
• økt kompilatoren optimalisering nivå av det binære

Krav :

Mac OS X 10.3