MultiGeneBlast er en åpen kildekode-verktøy basert på en reformatering av fasta overskrifter av NCBI GenBank proteinoppføringer, ved hjelp som det kan spore opp deres kilde nukleotid og koordinater. MultiGeneBlast kan hjelpe i påvisning av slike multigen deler for syntetisk biologi prosjekter. En syntetisk bibliotek av operoner kan skapes på grunnlag av dens utgang for å identifisere disse operoner hvis funksjon er nærmest en ønsket av brukeren. Dette verktøyet gir muligheter for å identifisere alle homologe genomiske regioner ved å kombinere resultatene av enkelt BlastP kjører på hvert gen, og sortering genomiske regioner fra en hvilken som helst GenBank-innsettelse av antall treff, synteny konservering, og kumulativ Blast-bit resultat. Arkitektur søk kan utføres for å finne noen genomiske regioner med Blast treff på alle brukerdefinert kombinasjon av aminosyresekvensene.
Kommentarer ikke funnet