Best Bioinformatikk For Linux

NetAtlas er en Cytoscape plugin som benytter vev genuttrykk data for å filtrere mobilsignalnettverk. NetAtlas identifiserer vev definerte nettverk, vevsspesifikke nettverkskomponenter og komponenter med korrelerte uttrykk på tvers av...

CLC Sequence Viewer skaper et programvaremiljø som gjør det mulig for brukere å gjøre grunnleggende bioinformatikk analyser og glatt data management, kombinert med gode grafiske visnings og utenheter.Her er noen viktige trekk ved "CLC Free Workbench":-...

Seal er et Python-modul som gir sekvens innretting på Hadoop.Seal er en av MapReduce søknad om biologisk sekvenssammenstillingen. Det kjører på Hadoop (http://hadoop.apache.org) gjennom Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), en Python MapReduce og HDFS...

biotools er en haug med bioinformatikk verktøy skrevet i Python Krav . ...

Pysam er et Python-modul for å lese og manipulere Samfiles. & Nbsp; Det er en lett wrapper av samtools C-API.Hurtigstartveiledningen er her. Mer detaljert dokumentasjon er tilgjengelig her.Spørsmål og kommentarer er velkomne, og skal sendes til den pysam...

. HTSeq er en Python rammeverk for å behandle og analysere data fra high-throughput sekvensering (HTS) analyser Krav : < li>...

checkmyclones er en programvare som gir verktøy for å sjekke Sanger-sekvensering resultater. & Nbsp; (eller ren tekst eller FASTQ filer) mot et sett med referansesekvenser, gitt i enhver rimelig format (inkludert koordinater) Krav ...

RFLP Planner er et verktøy som bidrar til å planlegge en RFLP eksperiment: Den finner restriksjonsenzymer som skjærer et sett av homologe DNA-sekvenser på forskjellige måter og simulerer den resulterende gel-elektroforese bilde. Programmet hjelper deg å...

CodonW er et program utviklet for å forenkle multivariat analyse (korrespondanseanalyse) av kodon og aminosyre bruk. Den beregner også standard indekser av kodonbruk. Den har både menyen og kommandolinjegrensesnitt.Den CodonW Prosjektet ble skrevet av...

Adun prosjektet er en utvidbar biomolekylære simuleringsprogram som inkluderer data management og analyse.Adun gir avanserte algoritmer og protokoller for molekylær simulering som kan nås fra et intuitivt brukergrensesnitt, men også fra en mer fleksibel...