Best Bioinformatikk For Linux

Bygg systemer som gjør blir ofte brukt til å lage komplisert arbeidsflyt, f.eks i bioinformatikk. & nbsp; snakemake mål å redusere kompleksiteten i å lage arbeidsflyter ved å gi en ren og moderne domenespesifikk spesifikasjon språk (DSL) i python stil,...

CLC DNA Workbench skaper et programvaremiljø som gjør det mulig for brukere å gjøre et stort antall avanserte DNA sekvens analyser, kombinert med glatt data management, og gode grafiske visnings og utenheter.CLC DNA Workbench er tilgjengelig på Windows,...

seriesoftubes er en utvidet rørledning for Solexa ChIP-seq data.Pakke Dokumentasjon Krav : ...

STEME prosjektet startet livet som en tilnærming til Forventning-Maksimerings algoritme for den type modell som brukes i motiv finnerne som MEME.STEME & rsquo; s EM tilnærming kjører en størrelsesorden raskere enn den MEME implementering for typiske...

Genepidgin er en pakke med Python verktøy som hjelper i evaluering og tildeling genet produktnavn & nbsp; Det er tre primære komponenter.:genepidgin * renere *& Nbsp; standardiserer genet navn per Uniprot navne retningslinjergenepidgin * sammenligne *&...

Miso (Blanding av Isoformer) er en sannsynlighets rammeverk skrevet i Python som quantitates uttrykket nivå & nbsp; av alternativt skjøtes gener fra RNA-Seq data, og identifiserer differensielt regulerte isoformer eller eksoner tvers prøver.Ved å...

Pathomx (tidligere MetaPath) er en åpen kildekode grafisk programvare implementert i IPython, Qt og PyQt, designet fra bunnen av for å fungere som en interaktiv verktøy for visualisering og analyse av metabolske dataene under GNU / Linux og andre POSIX &...

Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er et effektivt program som justerer relativt korte nukleotidsekvenser mot en lang referanse sekvens slik som det menneskelige genom.Programvaren implementerer to algoritmer, BWA-kort og BWA-SW. Den tidligere verk for...

avalanchetoolbox er en verktøykasse for å identifisere og beskrive forgrening prosesser, for eksempel nevronale snøskred Krav . ...

OpenElectrophy er et rammeverk for å lette manipulering, lagring og analyse av elektrofysiologiske data. Det kan importere data fra mange forskjellige filformater og lagre dem i en enkelt SQL-type database.Analyseverktøy som inngår i OpenELectrophy er...