MACS2

MACS2 er en modell basert analyseverktøy for chip-Seq data.
Med forbedring av sekvense teknikker, etterfulgt kromatin immunutfelling av høy gjennomstrømming sekvensering (ChIP-Seq) blir populært å studere på genom protein-DNA interaksjoner. Å løse mangelen på kraftig brikke-Seq analysemetode, presenterer vi en ny algoritme, oppkalt Modellbasert analyse av ChIP-Seq (MACS), for å identifisere transkripsjon faktor bindingssteder. MACS fanger påvirkning av genomet kompleksitet for å vurdere betydningen av anriket chip regioner, og MACS forbedrer den romlige oppløsningen av bindingsseter ved å kombinere informasjonen fra begge sekvense tag posisjon og orientering. . MACS lett kan brukes for chip-Seq data alene, eller med kontrollprøve med økningen av spesifisitet

Krav :

• Python