GENESIS (forkortelse for generell nevrale simulering System) er et generelt simulering plattform som ble utviklet for å støtte simulering av nevrale systemer som spenner fra subcellulære komponenter og biokjemiske reaksjoner på komplekse modeller av single nevroner, simuleringer av store nettverk og systemer- nivå modeller.
GENESIS har gitt grunnlag for laboratoriekurs i nevrale simulering ved Caltech, Marine Biological Laboratory, Kreta, Trieste, Bangalore, og Obidos korte kurs i Computational Neuroscience, og minst 49 universiteter som vi er klar over.
De fleste aktuelle GENESIS applikasjoner bære realistiske simuleringer av biologiske nevrale systemer. Selv om programvaren kan også modellere mer abstrakte nettverk, andre simulatorer er mer egnet for backpropagation og lignende konneksjonistisk modellering.
Installasjon
1. Velg stedet der du ønsker å installere "Genesis" katalogtreet. Hvis du gjør en systemomfattende installasjon som "root" bruker, usr / local er / et godt valg. For en personlig installasjon, uten root-tilgang, kan du bruke ditt hjemmeområde ("~"). Bytt til denne katalogen og pakke tilblivelsen katalog fra arkivfilen genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. For eksempel,
cd / usr / local
tjære xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
eller fra hvor du har det (f.eks ~ / nedlastinger / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. Gå til "Genesis" katalogen og kjøre setup script som skaper ".simrc" GENESIS initialisering fil ". Deretter kopierer .simrc til hjemmekatalogen.
cd genesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. Finallly, legge tilblivelsen katalogen til søket banen, slik at "Genesis" kan være funnet fra en katalog som du er i. Hvis påloggings skallet er bash, kan du gjøre dette ved å redigere .bashrc fil i hjemmekatalogen å legge linjen
PATH = $ PATH: / usr / local / genesis
ved slutten av filen. Hvis du bruker tcsh eller csh som kommandoskall, legge
set path = ($ path / usr / local / genesis)
til .tcsh eller .csh fil.
På dette punktet, er du klar til å prøve å kjøre GENESIS. Endre til katalogen genesis / Scripts og prøve noen av de tutorials foreslått i README-filen
Hva er nytt i denne utgaven.
- Mange feilrettinger og forbedringer.
Kommentarer ikke funnet