Gratis Bioinformatikk For Linux
STEPS er en pakke for eksakt stokastisk simulering av reaksjon-diffusjonssystemer i vilkårlig komplekse 3D-geometrier. Vår kjerne simulering algoritmen er en implementering av Gillespie er SSA, utvides til å håndtere diffusjon av molekyler over elementene...
tapir er et Python verktøy som inneholder programmer for å beregne og plotte fylogenetisk informativeness for store datasett. Siterer tapir Ved bruk av tapir, vennligst oppgi:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: tapir gir høy gjennomstrømning analyse av...
picme er en Python pakke som inneholder programmer for å beregne og plotte fylogenetisk informativeness for store datasett. Installasjon For øyeblikket er den enkleste måten å installere programmet:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git / sti...
tigreBrowser er et genuttrykk modell nettleser for resultater fra tigre R pakke (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installasjon: tigreBrowser krever Python versjon> = 2,5. tigreBrowser kan installeres med følgende...
checkmyclones er en programvare som gir verktøy for å sjekke Sanger-sekvensering resultater. & Nbsp; (eller ren tekst eller FASTQ filer) mot et sett med referansesekvenser, gitt i enhver rimelig format (inkludert koordinater) Krav ...
Syntainia er et nyskapende program for visualisering av flere genomer. & Nbsp; Den presenterer et enkelt og intuitivt brukergrensesnitt for å vise og manipulere relasjoner mellom grupper av gener. Med en klarere gen visualisering, er det lettere for...
CWC Simulator er et C ++ gjennomføring av CWC, en beregning for representasjon og simulering av biologiske systemer. & Nbsp; Etter en vellykket installasjon (se INSTALL) vil du være i stand til å kjøre simuleringer enn CWC modeller, som vist i noen...
Arem er en basert på MACS (modellbasert analyse for ChIP-sekv data).High-throughput sekvense koplet til kromatin immuno- utfelling (chip Seq) er mye brukt for å karakter genom-wide bindende mønstre av transkripsjonsfaktorer, kofaktorer, kromatin...
AHREA er en sofware pakke som gjør finne Relativ Expression elever lett. . Det er skrevet i Python Krav ...
E-Cell System er et konsept for å bygge virtuelle celler på datamaskiner.E-Cell System er et objektorientert programvarepakke for modellering, simulering og analyse av storskala komplekse systemer som biologiske celler, bygd for ved Kouichi Takahashi og...
