Må ha Bioinformatikk For Linux
goby er en Python API for å lese binære datafiler opprettet ved hjelp av Goby neste generasjons data management rammeverk.Normalt kommer denne katalogen som en del av den komplette Goby pakken, tilgjengelig fra:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Den...
. HTSeq er en Python rammeverk for å behandle og analysere data fra high-throughput sekvensering (HTS) analyser Krav : < li>...
Jmol er en åpen kildekode, kryssplattform og gratis grafisk programvare som opprinnelig ble utviklet for å fungere som molekylærviser for 3D-kjemiske strukturer. Den går i fire frittstående moduser, som en HTML5 web app, et Java-program, en Java-applet...
LSim ligger oppå makromolekylelektrontettheten og beregner en strukturell likhet poengsum. Dens beregninger skalere lineært med størrelsen av molekylene som sammenlignes.De LSim justeringer er konseptuelt relatert til biokjemiske strukturelle elementer,...
MacMolPlt er et moderne grafikk program for å plotte 3-D molekylære strukturer og normal modus (vibrasjoner). Moderne...
MACS2 er en modell basert analyseverktøy for chip-Seq data.Med forbedring av sekvense teknikker, etterfulgt kromatin immunutfelling av høy gjennomstrømming sekvensering (ChIP-Seq) blir populært å studere på genom protein-DNA interaksjoner. Å løse mangelen...
massXpert massespektrometri pakken er en massespektrometri miljø for lineær (bio-) polymerer. Det arver alle nyvinningene til GNU polyxmass, som det er en port av det prosjektet til en kryssplattform utviklingsmiljø Hva er nytt i denne utgaven. ...
MetagenomeDB er en Python bibliotek designet for enkelt å lagre, hente og kommentere metagenomic sekvenser. & Nbsp; MetagenomeDB fungere som en abstraksjon lag på toppen av en MongoDB database. Det gir en API for å opprette og endre og koble to typer...
Miso (Blanding av Isoformer) er en sannsynlighets rammeverk skrevet i Python som quantitates uttrykket nivå & nbsp; av alternativt skjøtes gener fra RNA-Seq data, og identifiserer differensielt regulerte isoformer eller eksoner tvers prøver.Ved å...
mpiBLAST er en MPI basert parallell gjennomføring av NCBI BLAST. Prosjektet består av et par programmer som erstatter formatdb og blastall med versjoner som utfører BLAST jobber parallelt på en klynge av datamaskiner med MPI installert. Det er to primære...
