Ny Bioinformatikk For Linux
Geant4 prosjektet er en verktøykasse for simulering av passering av partikler gjennom saken.Dets bruksområder inkluderer høy energifysikk og kjernefysiske eksperimenter, medisinsk, akselerator og romfysikk studier Hva er nytt i denne utgaven:. En...
STEME prosjektet startet livet som en tilnærming til Forventning-Maksimerings algoritme for den type modell som brukes i motiv finnerne som MEME.STEME & rsquo; s EM tilnærming kjører en størrelsesorden raskere enn den MEME implementering for typiske...
Genepidgin er en pakke med Python verktøy som hjelper i evaluering og tildeling genet produktnavn & nbsp; Det er tre primære komponenter.:genepidgin * renere *& Nbsp; standardiserer genet navn per Uniprot navne retningslinjergenepidgin * sammenligne *&...
capsid er en omfattende åpen kildekode-plattform som integrerer en høyytelses beregnings rørledning for patogen sekvens identifisering & nbsp; og karakterisering i menneskelige genomer og transcriptomes sammen med en skalerbar resultater database og et...
Miso (Blanding av Isoformer) er en sannsynlighets rammeverk skrevet i Python som quantitates uttrykket nivå & nbsp; av alternativt skjøtes gener fra RNA-Seq data, og identifiserer differensielt regulerte isoformer eller eksoner tvers prøver.Ved å...
MACS2 er en modell basert analyseverktøy for chip-Seq data.Med forbedring av sekvense teknikker, etterfulgt kromatin immunutfelling av høy gjennomstrømming sekvensering (ChIP-Seq) blir populært å studere på genom protein-DNA interaksjoner. Å løse mangelen...
biotools er en haug med bioinformatikk verktøy skrevet i Python Krav . ...
PathVisio er en åpen kildekode og helt gratis grafisk applikasjon implementert i Java programmeringsspråk og designet fra bunnen av for å bli brukt til å vise, analysere og redigering av biologiske mekanismer under en GNU / Linux operativsystem system.Can...
Pathomx (tidligere MetaPath) er en åpen kildekode grafisk programvare implementert i IPython, Qt og PyQt, designet fra bunnen av for å fungere som en interaktiv verktøy for visualisering og analyse av metabolske dataene under GNU / Linux og andre POSIX &...
